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mRNA层析纯化:

mRNA体外转录(IVT)副产物dsRNA对mRNA的影响仍在不断探索中,目前大量的证据支持有效去除dsRNA对于mRNA开发的益处。基于dsRNA副产物对mRNA相关研究的负面干扰,科研人员亟需高纯度mRNA用于体内外试验,尤其是用于小鼠等动物模型的体内研究。

相比氯化锂(LiCl)沉淀和磁珠法,层析纯化方案可针对性去除IVT反应混合物中的dsRNA杂质,从而减少其对实验的不良影响。

mRNA纯化方法的比较

纯化方法 氯化锂沉淀法 氯化锂沉淀法 磁珠纯化法 层析法
纯化原理 盐析选择性沉淀RNA 磁珠吸附RNA 亲和层析:polyA与oligo dT特异性结合
离子交换层析:根据电荷差异分离物质
核心操作 离心为主A 磁珠吸附/清洗 清洗-上样-洗杂-洗脱-清洗
操作时间 30-60 min 15-30 min 60 min以上
mRNA纯度 低(含非目标RNA) 较高(去除大部分杂质) 极高(两步层析后mRNA纯度和完整性通常可达95%以上)
应用场景 小批量mRNA的简易纯化
细胞转染(体外研究)
大批量、更高质量mRNA的纯化
动物试验(体内研究)

案例分享

为满足实验人员对高纯度mRNA的需求,青鸟核酸在科研级样品的标准纯化工艺(氯化锂沉淀)基础上增加Oligo dT亲和层析后,能够将mRNA样品中的dsRNA控制在为0.9(0.090 ng/μg)。此外,在Oligo dT亲和层析后增加DEAE离子交换层析或者疏水层析,能够进一步去除21.43%或7.89%的残留dsRNA,mRNA纯度和完整性也达到了95%以上。