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抗体偶联LNP实验教程!宾大Mitchell团队Nature Protocol发文

2026-05-22

该实验教程基于宾夕法尼亚大学Michael J. Mitchell团队2026年3月9日在《Nature Protocols》上发表的研究成果:Preparation of targeted lipid nanoparticles for precision nucleic acid delivery,旨在为实验室人员提供制备抗体偶联靶向脂质纳米颗粒(tLNP)的标准化流程。更多实验细节请查看文献原文(添加小编微信获取PDF原文:188 5265 8090)。

该方案解决了传统LNP在体内递送时主要蓄积于肝脏、难以进入特定细胞或肝外组织的局限性。其核心优势在于:

  1. 反应稳定性高:采用应变促进的叠氮-炔环加成(SPAAC)点击化学,反应条件温和(室温),生成的三唑键在生理环境下及还原压力下极度稳定。
  2. 生物正交性强:SPAAC反应对氧气和水不敏感,且具有高度的选择性,能最大程度保留抗体活性和LNP的结构完整性。
  3. 模块化设计:该流程具有高度的通用性,兼容任何LNP配方、抗体类型或核酸载荷(如mRNA、siRNA、pDNA等)。
  4. 无需特殊设备:仅使用离心机、微流控设备和重力色谱柱即可完成制备。

01 实验须知

关键试剂与耗材:

  • 叠氮脂质(接口):DSPE-PEG2000-azide(Avanti Polar Lipids,货号:880228)。
  • 抗体标记试剂:TFP ester-PEG(4)-DBCO(Thermo Fisher Scientific,货号:C20039)。
  • 纯化树脂:Sepharose CL-4B(Millipore Sigma,货号:CL4B200)。
  • 检测计:Quant-it RiboGreen(Thermo Fisher Scientific,货号:R11491)。
  • 离心管/膜:10-kDa及100-kDa MWCO超滤管。

实验时长:

  • 抗体准备与标记:0.5–1天。
  • LNP制备与偶联:1–2天。
  • 纯化与理化表征:1天。
  • 体内外验证:3–4天。

经验之谈(重点):

  • 彻底清除叠氮化钠:商业抗体通常含有叠氮化钠防腐剂,它会与DBCO反应,因此标记前必须进行彻底的缓冲液置换。
  • 严格控制标记度(DOL):标记度建议目标为6,过高会导致标记位点靠近抗体结合界面,从而影响抗原亲和力,甚至在体内诱发免疫反应。
  • 确保SEC柱容积:SEC重力柱的树脂装填体积必须≥20 ml,否则无法有效分离tLNP与游离抗体。
  • 防止树脂干燥:纯化柱在操作过程中必须始终保持湿润,一旦干燥会出现裂缝,导致分离失败。
  • 禁止冻融:制备好的tLNP应于4 °C保存并在2周内使用,严禁冷冻。

02 详细的实验流程

一、 抗体前处理:脱盐、浓缩与酶切 (Part 1)

  1. 缓冲液置换:使用脱盐柱(1,500g离心1-2分钟)或20-kDa透析卡,将抗体置换至超纯水中。

目的:去除干扰标记的叠氮化钠,并确保浓度达到1–2 mg/ml的最佳标记范围。

  1. 抗体片段化(可选):根据抗体亚型选择合适的酶(如IgG1用Ficin,IgG2a用Pepsin),切除Fc段生成F(ab')2片段。

目的:减少Fc段引起的免疫原性或非特异性清除。

二、 抗体DBCO标记与DOL表征 (Part 2)

  1. 配制DBCO溶液:将TFP ester-PEG(4)-DBCO溶解于无水DMSO中,配置成3.5 mM储存液。
  2. 偶联标记:按10–20倍摩尔过量将DBCO加入抗体溶液中,在恒温混匀仪上室温、400 rpm震荡2小时。
  3. 标记纯化:使用Zeba脱盐柱(1,500g离心2分钟)去除多余的游离DBCO。
  4. 计算DOL:利用紫外吸光度(280/309 nm)计算抗体的标记度,确保DOL接近6。

三、 Azide-LNP的合成与抗体偶联 (Part 3)

  1. 微流控混合:将含有叠氮脂质的有机相与mRNA水相按1:3的流速比(总流速约2,400 µl/min)在芯片内混合。
  2. 荧光染色与透析:加入0.5 mol%的DiR染料后,针对PBS透析2小时以去除乙醇。
  3. 点击化学偶联:按抗体:叠氮脂质 = 1:200的摩尔比加入标记后的抗体,在室温下350 rpm震荡孵育18–24小时。

四、 tLNP的纯化鉴定与质控 (Part 4-5)

  1. SEC纯化:将偶联产物上样至装填有Sepharose CL-4B的20 ml重力柱,使用PBS洗脱并收集96个流分。

目的:利用尺寸差异让体积巨大的tLNP先流出,而较小的游离抗体滞留在柱内。

  1. 识别tLNP组分:向各孔样品加入0.1% Triton X-100裂解LNP,随后加入RiboGreen试剂,荧光最强的孔即为目标组分。
  2. 合并与浓缩:合并含有mRNA的孔,使用100-kDa超滤管在800g、4 °C下离心至目标体积。
  3. 表征检测:通过DLS测量粒径(成功的偶联通常伴随粒径增加)和Zeta电位。

五、 体内外靶向效果评价 (Part 6-7)

  1. 体内验证:通过尾静脉或球后注射(剂量如1.5 µg mRNA/小鼠),给药4–12小时后腹腔注射150 mg/kg荧光素,利用IVIS成像检测器官生物分布与发光信号。
  2. 离体验证:针对激活后的T细胞(CD3/CD28 Dynabeads激活≥18小时),加入tLNP并在1、4、24小时点利用流式细胞术检测DiR(摄取)和报告蛋白(转染)。

Troubleshooting 速查表

步骤常见问题可能原因解决方案
Part 1 (Step 3)凝胶电泳显示抗体片段化(酶切)效果差酶选择错误。根据抗体亚型重新确认酶的兼容性(参考表3)。
Part 2 (Step 8)抗体浓度无法检出或远低于预期标记量太少;在缓冲液置换过程中产生吸附损耗;Qubit校准时未考虑缓冲液污染物。增加起始抗体量;换用回收率更高的缓冲液置换法(如脱盐柱);参考厂家手册处理污染物。
Part 2 (Step 9)标记度(DOL)远低于 6DBCO 标记不成功。增加 DBCO 的摩尔过量倍数或延长反应时间。
Part 2 (Step 9)标记度(DOL)远高于 6DBCO 加入量过多;抗体浓度太低导致吸光度读数不准。减少 DBCO 加入量;增加标记实验的起始抗体量。
Part 5 (Step 33)mRNA tLNP 组分跨越的流分数(孔数)过多纯化柱老化,树脂床完整性受损。重新填装新鲜的 SEC 纯化柱。
Part 5 (Step 36)DLS 检测未观察到粒径增加抗体未成功偶联;LNP 发生聚集;tLNP 浓度过高干扰检测。使用荧光抗体验证信号重叠情况;制备 DLS 样品前充分混匀;进一步稀释样品后重测。
Part 5 (Step 37)mRNA 回收浓度过低微流控混合效率差。重新配置新鲜的脂质储存液;增大制备批次规模以减少体积损耗。
Part 5 (Step 38)荧光标记抗体的洗脱峰显著滞后于 tLNP 峰抗体未偶联至 LNP 表面。优化 DOL 至 6–8;增加抗体与脂质的比例;延长偶联孵育时间至 24–36 小时。
Part 5 (Step 38)tLNP 与游离抗体分离度差(峰重叠)纯化柱体积不足;树脂床高度不够。确保树脂装填体积至少 20 ml;尝试换用更细长的色谱柱。
Part 6 (Step 45)IVIS 成像未检测到荧光或发光信号LNP 结构失效;静脉注射失败(脱靶);荧光素底物注射不当。确认 LNP 的粒径、PDI 及包封率;检查注射技术。
Part 6/7 (46 & 56)tLNP 与对照组相比未显示靶向性抗体未成功偶联;靶标受体表达量低或选错靶标。参考 Step 38 解决方案验证偶联;通过流式细胞术确认目标细胞受体表达情况。
Part 7 (Step 55)所有细胞群体的 DiR 阳性率均 >90%DiR 荧光信号过强。制备时减少 DiR 添加量;调低流式细胞仪检测电压/激光功率。

Geisler HC, Battistini E, Thatte AS, Padilla MS, Mitchell MJ. Preparation of targeted lipid nanoparticles for precision nucleic acid delivery. Nat Protoc. 2026 Mar 9.